信誉好的立式加工中心之所以具有较为先进的加工能力和加工精度，原因在于其自身配置了代表当今装备制造业制造能力的先进功能部件。其中，刀库及自动换刀装置因是其标志性配置自不必说。其所配置的CNC数控系统是众多部件当中最为关键的部件，进而本文进行详细概述立式加工中心配置的CNC数控系统的补偿功能。
一、丝杠螺距误差补偿
滚珠丝杠、伺服控制系统和在线位置检测装置，是立式加工中心基本的进给系统。滚珠丝杠在长时间使用出现的间隙误差以及测量系统在机床上的安装误差都会导致机床进给的失真，为了消除这两种误差，需要立式加工中心CNC数控系统具有螺距误差补偿的功能。
二、反向间隙补偿
在机床移动部件和其驱动部件，如滚珠丝杠，之间进行力的传递时导致运动路径与测量系统的测量值之间存在偏差。在机床相应进给轴上使用反向间隙补偿功能的重要性。从而避免立式加工中心一旦方向改变，进给系统会运动得过远或过近，严重影响机床的定位精度的问题，从而不会造成加工超差。
三、角度误差补偿
立式加工中心是高速运行的机床，由机床的自重及惯性或者刀具和工件重量，会所导致移动轴没有以正确的角度互相对齐。随着零点位置的偏移不断增加，位置误差也会铸件增大，这种误差叫做角度误差。角度误差补偿首先应在调试时测得的实际的误差值，然后将这一数值储存在立式加工中心CNC数控系统中，在机床运行时，相关轴的位置根据存储点的补偿值进行插补，以便消除这种误差。
四、象限误差补偿
象限误差补偿，又称为摩擦补偿。出现这种误差的原因是，当立式加工中心加工时一个轴以最高进给速度移动，而另一轴则静止不动。两轴的不同摩擦行为可能导致轮廓误差。象限误差补偿可有效地减小此误差并确保机床的加工精度。
此外，在较新型的CNC数控系统及高端立式加工中心配置中，并且一流的立式加工中心其补偿功能还应包括温度补偿、空间误差补偿、偏差补偿、以及电子配重补偿等几个实用功能，因篇幅有限，本文就不在进行详细赘述，有兴趣的朋友可以查阅其他相关书籍了解。
